可以合并申请，也可以分开申请1、如果是合并申请，需要把管理端、PC用户端，APP端使用说明合并在一起；至于代码文档可以从整个软件源码挑选核心代码附到文档上2、如果是分开申请，命名需要注意，名称上要明确体现出管理端、pc用户端、APP端；代码文档选择对应的代码附到文档上，切记不可混淆。
申请软著需要哪些材料？1、软件用户手册：即软件使用说明，手册内容以15页以上为佳，包含封面，目录，软件概述，设计说明，逻辑开发架构，软件使用说明等内容，其中主要内容为软件使用说明，图文形式另外页眉需要加上软著名称+版本号+页码。
2、软件源代码文档：按版权中心要求，需提供前1500和后1500行代码，也就是3000行代码，每页50行；不足3000行则全部提供，但建议尽量提供3000行，不够的可想办法补足；另外代码文档建议加上中文注释，利于审核通过。
3、功能特点：也就是软件的开发运行环境，开发语言，代码总行数，目的，行业，主要功能和技术特点等，这个没啥可说的，根据软件情况直接套就行，版权中心对这一块的审核力度不是那么强，附上功能特点说明，直接复制粘贴即可。
如果您有以下任意一种情况，建议可委托代理申请：1、没有真实软件：不建议自己申请，没办法写核心材料，建议委托代办申请；2、企业申报项目需要软著：这种需要的量比较大，自己申请无法保证软著下证数量；3、不会写材料，不了解申报流程：建议找代办申请，节省时间，下证率有保障；
4、着急下证：自己申请不能走加急渠道，代办可以走加急，并且自己申请一旦驳回，也会增加下证时间；5、多次驳回的：软著驳回属于正常情况，但多次驳回无论是自己申请还是代办申请。
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