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wufei123 发布于 2024-09-04 阅读(2)

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一GEO数据挖掘ceRNA机制(19节课,适用于肿瘤非肿瘤)01、数据库简介02、下载数据03 ID转换04 添加基因属性05 差异表达06 热图绘制07 GPL转fasta08 重注释比对结果09 比对结果ID转换

10 基因属性11 基因表达和火山图12 绘制热图13 lncRNA结合的miRNA14 miRNA靶基因的预测mp415Cytoscape输入文件准备16CeRNA网络构建17基因名称转换为基因ID18GO分析

19KEGG分析20 课程数据文件及万能代码二、TCGA数据lncRNA共表达网络构建(8节课,肿瘤)01.共表达方法预测lncRNA靶基因简介_ok02.基因矩阵文件加上基因属性_ok03.LncRNA共表达分析_ok

04.基因名字转换成基因id_ok05.靶基因的GO富集分析_ok06.靶基因的KEGG富集分析_ok07.富集结果中的id转换成symbol_ok08 课程数据文件及万能代码三TCGA数据挖掘视频教程一(15节课,挖掘差异基因)

01、数据库简介02、网页下载数据03、命令行下载数据04、生成矩阵05、id转换成基因名06、差异表达介绍07、edgeR差异表达08、DESeq差异表达09、miRNA数据下载与整理10、miRNA差异表达

11、共表达数据合并12、WGCNA13、生存分析介绍14、生存分析数据准备15、R做生存分析16、课程数据及万能代码四TCGA数据挖掘视频教程二(挖掘差异miRNA)01、课程简介02、Rstudio重点配置与报错排除

03、最新TCGA-RNA表达数据下载与整理04、RNA差异表达分析05、ROC曲线06、TCGA临床数据下载与整理07、基因表达与临床因素相关性08、临床分组表达量分析09、生存分析10、COX分析11、列线图模型

12、基因表达拷贝数甲基化13、成熟体miRNA表达数据下载与整理14、miRNA差异表达分析15、靶基因分析16、基因与miRNA表达相关性分析17、miRNA生存分析18、GSEA分析19、cBioPortal分析复现

20、课程数据及万能代码五TCGA数据挖掘视频教程三(挖掘转录因子网络)01、简介02、TCGA数据下载03、TCGA命令行下载04、TCGA数据整理05、TCGA的id转换06、mRNA提取07、mRNA差异表达

08、IncRNA提取09、IncRNA差异表达10、转录因子富集分析11、转录因子数据整理12、cytoscape下载和安装13、cytoscape构建转录因子调控网络14、课程数据及万能代码六TCGA数据挖掘视频教程四(挖掘ceRNA网络)

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07、课程数据及万能代码十TCGA数据库SNP突变数据分析01、TCGA数据库SNP突变分析简介02、突变数据下载03、突变数据整理和统计04、瀑布图输入文件准备05、瀑布图06、带临床性状瀑布图数据准备

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16、位点生存分析文件准备17、位点生存曲线18、课程数据及万能代码11TCGA数据库CNV拷贝数变异分析01、CNV简介02、数据下载03、基因注释04、数据整理合并05、卡方检验输入文件准备06、正常和癌症的CNV差异

07、圆圈输入文件准备08、CNV绘制09、提取差异基因的CNV矩阵10、差异CNV基因和表达数据合并11、CNV和表达水平的相关性检验12、CNV和表达水平的可视化13、基因名字转换成ID14、GO富集分析

15、KEGG通路富集分析16、课程数据及万能代码12TCGAimmune免疫细胞浸润01、肿瘤免疫侵润简介02、TCGA数据下载03、数据整理04、提取mRNA05、数据矫正06、CIBERSORT运行.

07、CIBERSORT结果整理08、柱状图绘制09、热图绘制10、相关性热图绘制11、小提琴图绘制12、临床数据下载13、临床数据整理14、免疫细胞矩阵和生存时间合并15、免疫细胞批量化生存分析16、免疫细胞矩阵和临床性状合并

17、批量临床相关性分析18、批量临床相关性19、课程数据及万能代码13生信分析+免疫,妥妥上5分!01、下载TCGA数据02、计算样本免疫微环境评分03、免疫微环境评分与各个临床特征的关系04、免疫微环境评分高低与预后的关系.

05、免疫微环境评分高低样本的基因表达差异06、这些差异基因与预后的关系,筛选预后显著相关07、外部数据集验证这些基因.08、课程数据及万能代码以上是13套视频的内容,资源一共是15套,任何一套都有实操视频和课程资料:

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对话框输入关键词:15套对话框输入关键词:15套对话框输入关键词:15套02零代码复现6分纯生信SCI完整步骤之前复现一篇6分的纯生信SCI论文,是发表在Genomics上2区6.2分的SCI纯生信论文是这样的↓↓↓(2020年9月的,思路非常

新,值得学习(全程只要鼠标点点点就能发表)。

作者一共是用了6个结果图说明了SND1基因在肿瘤中的意义。第一张图是作者分析了 SND1 基因在各种组织及癌症中的表达情况↓↓↓。

接着第二张图作者进一步分析 SND1 基因的对癌症患者预后的影响↓↓↓。

第三到第六张图作者就分析了SND1基因可能通过什么机制影响了患者的预后?比如基因突变情况、蛋白磷酸化水平,以及与SND1互作的那些基因的功能富集分析所以,这一篇6分的SCI论文就是作者通过各种软件分析了。

SND1基因可能通过什么机制而导致癌症的发生发展这样的一篇SCI论文,全程只要鼠标点点点就行那么,我们跟着他一样的操作,把SND1基因换成另外一个基因,就是一篇SCI,全程操作只要1小时就能做完,简直太方便了。

具体怎么操作呢?第一个结果 SND1 基因在各种组织及癌症中的表达情况---用哪个软件,点哪里?第二个结果SND1 基因的对癌症患者预后的影响---用什么软件,点哪里?基因突变情况、蛋白磷酸化水平、与SND1互作基因的预测等等---

用什么软件,点哪里?不用担心,我们写了一份步骤↓↓↓,教你鼠标点点点完成以上分析,傻瓜式操作,帮你节约更多的时间,快速助你文章产出。“45页实操步骤(原价2899元)”

(45页实操步骤部分截图)每一步打开什么软件,鼠标点哪里,只要跟着我的鼠标箭头点就行,就能把这篇6分的SCI论文做出来然后,把SND1换一个基因,再继续操作一遍这样,我们自己就能发表至少3分的SCI论文,一天的时间就能发表。

因为,微信推文篇幅有限,所以原文和这一份实操步骤免费发送给大家,祝大家多多SCI论文。

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回复关键词:45页03Excel做统计分析万能模板(19种)一位朋友跟我说,他按照老师的意思收集了很多临床数据但是尴尬的是,数据拿到手了,却不知道用哪一种统计学方法也不知道怎么操作统计分析那我们给大家总结下,首先要知道自己的数据是什么数据,然后用哪一种统计学方法:。

那么,有了这个流程图,剩下的就是怎么操作了临床医生可能也没有时间学习所以,今天我们要给大家免费分享:“Excel统计分析万能模板(原价1299元)”这是万能模板,只要你知道自己用什么分析方法,然后把自己的数据输入进去,。

统计学结果立马自动出来了。wps和office是每一台电脑都有的软件吧,也不要去下载别的统计学软件。这个模板用起来主要是方便。模板如下:

那怎么用呢?我举个例子,你收集了50例癌症患者的皮肤癌组织,做了qPCR测得了WNT4基因的表达量;再取了60例正常人皮肤作为对照,也测得了WNT4基因的表达量要比较两组之间Wnt4基因的表达量哪个高,且有没有统计学意义。

那么,我们按照上面图的流程,我们知道这是独立样本,要判断数据是否正态,方差是否齐,然后再选择一个统计学方法那其实,你样本量大的时候,这个时候我们就可以直接用成组t检验,也就是资源中的第七个模板,我们打开模板,如下:。

只要替换数据就自动统计和出图(从上图可知,患者高于正常人,但是P大于0.05,没有统计学意义)。这个这么方便的模板我已经上传到百度云了,大家可以赶快下载收藏起来,你以后处理数据的时候会方便很多:

19种Excel统计分析万能模板(原价1299元)如下即可免费获取:①扫码关注

②对话框回复关键词:1904qPCR计算2^-△△Ct万能模板在临床上,比如我们收集了11个患者和15个正常人的样本(两组独立样本),然后做Wnt4基因和内参基因GAPDH的qRT-PCR定量,得到CT值。

接着我们要比较这个WNT4基因在哪个组里面表达高,哪个低也就是目的基因减去内参基因,计算它们的2^-△△Ct,并且分析出有没有统计学意义那应该怎么做呢?今天我们给大家整理了无脑操作的:“qPCR计算+差异分析万能模板”。

第一步、计算2^-△△Ct:先打开第一份模板,输入CT值(CT值是你自己机器上测得的哦),自动得到2^-△△Ct,如下:

第二步、差异分析:打开第二份万能模板,在患者和健康人那二列输入我们刚才得到的2^-△△Ct值,就自动分析好和出图了:

由此,我们知道Wnt4基因在患者中表达增高,但是P大于0.05,没有统计学意义有了这个Excel模板,操作就显得非常方便,直接输入CT值,便知道了结果,省了很多时间这一套万能qPCR计算模板我已经上传到百度云盘了:。

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这些视频都是从原理到实操,一个一个教学,非常牛。如流式的讲解:

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在对话框输入关键词:58068套优青/杰青/国家项目答辩PPT答辩非常重要,我们来看看各种人才奖励答辩材料的提交要求:杰青优青:目前已有数理学部、生命科学部等多个学部发了答辩通知,有的这几天就需要发邮件提交了,答辩材料要求提交mp4视频格式,15分钟,同时上传手动版:

 "视频汇报材料应为答辩者本人讲解PPT(MP4格式视频文件),建议编码方式为H264,大小不超过400M,播放时长不超过15分钟(超时部分学部将设置为停止播放)要求:文件配音必须由答辩者本人配音,不得采用专业配音,不得加入背景音乐。

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【模板4:优秀青年基金答辩】适用类型:各类基金项目申报答辩内容修改:内页版式设定全部内容可在PPT里自行修改模板页码:共25页

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